De eilanden kennen een rijke religieuze geschiedenis en vormden de thuisbasis voor de ridders van de Soevereine Militaire Hospitaalorde van Sint Jan, een van de vroegste verdedigers van het christendom.
De Maltese eilandbewoners behoren tot de oudste christelijke volkeren ter wereld. De apostel Paulus, die hier op weg naar Rome als gevangene schipbreuk leed in 60 na Christus, bracht het christendom naar Malta. De bezoeker kan in zijn voetstappen treden in de schrijnen, grotten en catacomben van Rabat en in de oude hoofdstad Mdina.
Er liggen maar liefst 365 kerken en kapellen verspreid over de eilanden. Elke stad of dorp heeft een parochiekerk in het centrum; de meeste plaatsen hebben meerdere kerken en kapellen. De barokkerken steken met hun opvallende rood of zilver geschilderde koepels prachtig af tegen de horizon. Ze zijn een wezenlijk onderdeel van het landschap van de eilanden, torenen boven de dorpspleinen uit en vormen het hart van het sociale en culturele leven op de Maltese eilanden.
De festa ter ere van de parochieheilige wordt nog altijd met veel overgave gevierd. Elke kerk is een architectonisch meesterwerk met een geheel eigen stijl en geschiedenis en heeft unieke relikwieën en schatten. Oudere kerken hebben vaak nog marmer, kristallen kroonluchters, schilderijen, fresco's en wandtapijten. Beelden van heiligen en van de Heilige Maagd Maria nemen in de meeste kerken een prominente plaats in.
Aangezien de lokale kalksteen zacht en gemakkelijk te bewerken is, hebben de Maltese beeldhouwers, architecten, aannemers en ambachtslieden de binnen- en buitenkant van de kerken op Malta en Gozo met verfijnde beelden kunnen versieren.
Misschien wel het meest intrigerend van alle religieuze plaatsen zijn de kleine kapelletjes langs de kant van de weg. Sommige zijn in de rots uitgehouwen, andere balanceren op een klif, maar ze hebben één ding gemeen: het zijn stuk voor stuk oases van rust en bezinning.